
- 2025-05-15 05:52:44單細(xì)胞分選
- 單細(xì)胞分選是一種用于分離和篩選單個細(xì)胞的技術(shù)。它基于細(xì)胞的物理或化學(xué)特性,如大小、形狀、表面標(biāo)記等,利用微流控技術(shù)或激光等方法,實現(xiàn)單個細(xì)胞的精確操控和分離。該技術(shù)廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究、疾病診斷、藥物篩選等領(lǐng)域,對于深入理解細(xì)胞異質(zhì)性、探索疾病機(jī)制、發(fā)現(xiàn)新的治療靶點具有重要意義。
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單細(xì)胞分選資訊
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- 單細(xì)胞脂質(zhì)組學(xué)新突破!單細(xì)胞可視化分選系統(tǒng)打破傳統(tǒng)困境,驅(qū)動高效精準(zhǔn)全鏈路分析
- 文中使用的單細(xì)胞可視化分選系統(tǒng)—isopick解決了微流控技術(shù)表征脂質(zhì)組學(xué)時面臨的一系列難題,可以實現(xiàn)高通量、高自動化的單個活細(xì)胞分離。
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- 性價比誰與爭鋒?大連華微新推單細(xì)胞分選儀僅售36.8萬 ——“HW-cyclone旋風(fēng)系列2023”單細(xì)胞液滴制備與分選系統(tǒng),破繭而出!
- 單細(xì)胞液滴制備與分選相應(yīng)耗材:華微生命的微流控芯片,更是達(dá)到驚人的低價:RMB200-600元/片,僅為進(jìn)口單價的1/10—1/5;一次性管線耗材,每次最 低只需10元人民幣……
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- 全國樣機(jī)巡展正式開始!QD中國科學(xué)實驗中心引進(jìn)單細(xì)胞可視化分選培養(yǎng)系統(tǒng),歡迎預(yù)約體驗!
- 近期,QD中國科學(xué)實驗中心全新引進(jìn)了由英國iotaSciences公司推出的單細(xì)胞可視化分選培養(yǎng)系統(tǒng)—isoCell。該設(shè)備具有高通量、自動化、高成活率等特點,可實現(xiàn)單克隆細(xì)胞系構(gòu)建、微生物分選與培養(yǎng)
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- 預(yù)算575萬元 北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部采購高通量活細(xì)胞成像分析系統(tǒng)
- 近日,北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部就高通量活細(xì)胞成像分析系統(tǒng)和高通量單細(xì)胞分選系統(tǒng)采購項目進(jìn)行公開招標(biāo),并于2024年10月11日 09點30分開標(biāo)。
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- Nature等子刊三連擊!單細(xì)胞力學(xué)斬獲三篇重量級成果,F(xiàn)luidFM 技術(shù)影響力大爆發(fā)
- 單近期,科研界迎來了一股新的熱潮,多功能單細(xì)胞顯微操作技術(shù)- FluidFM在這一浪潮中脫穎而出,連續(xù)發(fā)表三篇重要論文堪稱重磅之作。
單細(xì)胞分選文章
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- Cell重磅,膠質(zhì)母細(xì)胞瘤如何實現(xiàn)“免疫逃逸”,100%單細(xì)胞分選技術(shù)助力細(xì)胞系構(gòu)建!
- 膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(GBM)在基因組、轉(zhuǎn)錄組和表觀遺傳層面上表現(xiàn)出高度的腫瘤內(nèi)和腫瘤間異質(zhì)性。GBM與腫瘤免疫微環(huán)境之間的相互作用在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展中起著重要作用。然而,GBM如何促進(jìn)腫瘤免疫微環(huán)境的機(jī)制仍
單細(xì)胞分選產(chǎn)品
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- 單細(xì)胞分選分離器—HW-HURRICANE颶風(fēng)系列
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- 單細(xì)胞分選分離器—“HW-BREEZE” 微風(fēng)系列
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- 單細(xì)胞分選分離系統(tǒng)—龍卷風(fēng)系列“HW-TORNADO“
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單細(xì)胞分選問答
- 2023-03-07 22:09:15高通量單細(xì)胞力譜測定!多功能單細(xì)胞顯微操作技術(shù)助力單細(xì)胞力學(xué)研究
- 單程細(xì)胞具有復(fù)雜生物學(xué)性質(zhì),它們通過細(xì)胞外基質(zhì)ECM形成緊密的細(xì)胞與基質(zhì)細(xì)胞與細(xì)胞連接,諸如上皮細(xì)胞通過這種特殊的鏈接方式構(gòu)成了屏障層保護(hù)人體免受外界損傷。因此細(xì)胞之間以及細(xì)胞基底的粘附力測定對于研究細(xì)胞粘附蛋白的機(jī)制有著重要意義。使用力學(xué)工具測量細(xì)胞間以及細(xì)胞與基質(zhì)之間的粘附力始終不是一件容易的事情。首先,由于細(xì)胞與基質(zhì)的作用力僅為nN級別,因此需要力學(xué)精度較高的設(shè)備才能夠測量,而且在這其中較為適合的工具為原子力顯微鏡(AFM)。原子力顯微鏡能夠提供納米級別的操作精度并可測量從pN~nN范圍的力譜。但是受制于AFM探針本身的限制,需要借助修飾手段才能夠讓細(xì)胞與探針固定到一起,這個過程十分繁瑣,并且由于需要大量手工操作很難實現(xiàn)高通量的測量。而不同的細(xì)胞由于細(xì)胞異質(zhì)性使得要想確定粘附力需要較多樣本才能獲得相對準(zhǔn)確的值,無法實現(xiàn)高通量測量直接限制了原子力探針在細(xì)胞粘附力上的應(yīng)用。而多功能單細(xì)胞顯微操作FluidFM技術(shù)的出現(xiàn)改變了這一現(xiàn)狀,它使用特殊的中空探針能夠輕松地通過負(fù)壓抓取細(xì)胞,取得和AFM近似精度的數(shù)據(jù),無需在探針上進(jìn)行任何修飾,不會改變細(xì)胞表面的任何通路,從而能夠得到接近細(xì)胞原生的數(shù)據(jù)。在實驗結(jié)束后能夠通過正壓快速丟棄用過的細(xì)胞,具備很高的自動化,能夠快速測量細(xì)胞粘附力。使用FluidFM對細(xì)胞操作的基本流程 FluidFM在粘附力測量上具備顯著優(yōu)勢。如圖所示,F(xiàn)luidFM能夠通過負(fù)壓將細(xì)胞吸附到原子力探針的末端,通過高精度位移臺的控制將細(xì)胞從基底上分離,并且同時記錄FD曲線。通過FD曲線能夠獲得最大粘附力Fmax和粘附能量Emax。通過高度自動化的控制系統(tǒng)能夠在短時間內(nèi)測量大量細(xì)胞粘附力,評估細(xì)胞群體分布以及細(xì)胞間差異,并且可有效避免傳統(tǒng)粘附力測量因準(zhǔn)備時間過長而錯過最佳測量時間導(dǎo)致的細(xì)胞粘附力改變,得到更為精準(zhǔn)的結(jié)果。近期,Agoston等人使用多功能單細(xì)胞顯微操作系統(tǒng)FluidFM實現(xiàn)了高通量細(xì)胞粘附力測量,對同種細(xì)胞不同區(qū)以及不同細(xì)胞之間的粘附力進(jìn)行測量和比較。作者首先對Vero和Hela細(xì)胞在不同狀態(tài)下的粘附力進(jìn)行了測量和比較,總共測量了214個細(xì)胞。通過比較明膠涂層上處于單個細(xì)胞、孤島狀細(xì)胞、致密連接細(xì)胞以及單層細(xì)胞上游離細(xì)胞之間的粘附力,能夠明顯觀測到Vero細(xì)胞處于致密連接的細(xì)胞粘附力最大,大概在750 nN左右,隨著細(xì)胞單細(xì)胞層的稀疏,細(xì)胞粘附力有所下降,而處于細(xì)胞層頂部的細(xì)胞粘附力最低僅為50 nN左右。這一點充分說明上皮細(xì)胞能夠在細(xì)胞之間形成緊密的連接,而處于細(xì)胞層外的細(xì)胞則幾乎沒有粘附力。而對于HeLa這樣的腫瘤細(xì)胞測量的結(jié)果卻顯示出了截然不同的結(jié)果,處于不同狀態(tài)的細(xì)胞有著近似的粘附力,基本都在200 nN左右,這與處于單個游離上皮細(xì)胞的粘附力十分接近,表明HeLa細(xì)胞在不同環(huán)境下仍然具有較高遷徙能力。使用FluidFM對不同區(qū)域細(xì)胞的FD曲線測定結(jié)果和對比 通過對這兩種細(xì)胞的最大粘附力、最大粘附能量、最大拉伸距離和細(xì)胞接觸面積進(jìn)行統(tǒng)計分析可以發(fā)現(xiàn),HeLa腫瘤細(xì)胞在粘附力和粘附能量上均有所降低,但是當(dāng)HeLa細(xì)胞形成了單層后,兩者區(qū)別不大。對比Hela和Vero在不同生長狀態(tài)下的最大粘附力、最大粘附能量、粘附拉伸距離和粘附面積。再進(jìn)一步對Vero與HeLa細(xì)胞最大粘附力與距離和接觸面積進(jìn)行對比,依然可以得到與單獨比較粘附力相同的結(jié)果,并且最大能量與細(xì)胞接觸面積的比值中也存在著類似的結(jié)果。由此可見腫瘤細(xì)胞通過降低自身粘附力從而獲得了更好的遷移能力。對不同狀態(tài)Vero和A549之間的粘附力/粘附距離、粘附力/粘附面積、粘附能量/粘附面積 總結(jié) 細(xì)胞粘附力測定在細(xì)胞生命科學(xué)研究中起著至關(guān)重要的作用,然而傳統(tǒng)手段中有著各種各樣的局限性,主要原因是缺乏一種有效抓取細(xì)胞并進(jìn)行力學(xué)測定的手段?,F(xiàn)如今FluidFM技術(shù)在細(xì)胞粘附力測定中的應(yīng)用,使得研究者們有了一種能夠有效、低損的方式抓取細(xì)胞,配合原子力顯微鏡精確測量的特性,真正意義上做到精準(zhǔn)、無損、快速的測量單細(xì)胞粘附力,幫助研究者尋找細(xì)胞粘附力與細(xì)胞生命發(fā)展、腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移之間的關(guān)系。 【參考文獻(xiàn)】[1] A. Sancho, M. B. Taskin, L. Wistlich, P. Stahlhut, K. Wittmann, A. Rossi & J. Groll. Cell Adhesion Assessment Reveals a Higher Force per Contact Area on Fibrous Structures Compared to Flat Surfaces. ACS Biomater. Sci. Eng. 2022, 8, 2, 649–658.[2] P.W. Doll, K. Doll, A. Winkel, R. Thelen, R. Ahrens, M. Stiesch & A.E. Guber. Influence of the Available Surface Area and Cell Elasticity on Bacterial Adhesion Forces on Highly Ordered Silicon Nanopillars. ACS Omega. 2022, 7, 21, 17620–17631.[3] Sankaran, S. Jaatinen, L. Brinkmann, J. Zambelli, T. V?r?s, J. Jonkheijm, P. Cell adhesion on dynamic supramolecular surfaces probed by fluid force microscopy-based single-cell force spectroscopy. ACS Nano 2017, 11, 3867–3874.[4] Sancho, A. Vandersmissen, I. Craps, S. Luttun, A. Groll, J. A new strategy to measure intercellular adhesion forces in mature cell-cell contacts. Sci. Rep. 2017, 7, 46152.[5] Ines, Lüchtefeld. Alice, Bartolozzi. Julián M. M. Oana, Dobre. Michele, Basso. Tomaso, Zambelli. Massimo, Vassalli. Elasticity spectra as a tool to investigate actin cortex mechanics. J Nanobiotechnol. 2020, 18, 147.[6] Dehullu, J. Valotteau, C. Herman-Bausier, P. Garcia-Sherman, M. Mittelviefhaus, M. Vorholt, J. A. Lipke, P. N. Dufrene, Y. F. Fluidic force microscopy demonstrates that homophilic adhesion by Candida albicans Als proteins is mediated by amyloid bonds between cells. Nano Lett. 2019, 19, 3846–3853.[7] Mittelviefhaus, M. Müller, D. B. Zambelli, T. Vorholt, J. A. A modular atomic force microscopy approach reveals a large range of hydrophobic adhesion forces among bacterial members of the leaf microbiota. ISME J. 2019, 13, 1878–1882.[8] F. Weigl, C. Blum, A. Sancho & J. Groll. Correlative Analysis of Intra- versus Extracellular Cell Detachment Events vis the Alignment of Optical Imaging and Detachment Force Quantification. Adv. Mater. Technol. 2022, 2200195.【相關(guān)產(chǎn)品】 多功能單細(xì)胞顯微操作系統(tǒng)- FluidFM OMNIUM:http://sewtec.com.cn/zt2203/product_386418.html
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- 2023-02-24 11:28:18高通量、自動化單細(xì)胞力譜測定!多功能單細(xì)胞顯微操作全新技術(shù)助力單細(xì)胞力學(xué)研究
- 研究現(xiàn)狀單程細(xì)胞具有復(fù)雜生物學(xué)性質(zhì),它們通過細(xì)胞外基質(zhì)ECM形成緊密的細(xì)胞與基質(zhì)細(xì)胞與細(xì)胞連接,諸如上皮細(xì)胞通過這種特殊的鏈接方式構(gòu)成了屏障層保護(hù)人體免受外界損傷。因此細(xì)胞之間以及細(xì)胞基底的粘附力測定對于研究細(xì)胞粘附蛋白的機(jī)制有著重要意義。使用力學(xué)工具測量細(xì)胞間以及細(xì)胞與基質(zhì)之間的粘附力始終不是一件容易的事情。首先,由于細(xì)胞與基質(zhì)的作用力僅為nN級別,因此需要力學(xué)精度較高的設(shè)備才能夠測量,而且在這其中較為適合的工具為原子力顯微鏡(AFM)。原子力顯微鏡能夠提供納米級別的操作精度并可測量從pN~nN范圍的力譜。但是受制于AFM探針本身的限制,需要借助修飾手段才能夠讓細(xì)胞與探針固定到一起,這個過程十分繁瑣,并且由于需要大量手工操作很難實現(xiàn)高通量的測量。而不同的細(xì)胞由于細(xì)胞異質(zhì)性使得要想確定粘附力需要較多樣本才能獲得相對準(zhǔn)確的值,無法實現(xiàn)高通量測量直接限制了原子力探針在細(xì)胞粘附力上的應(yīng)用。多功能單細(xì)胞顯微操作FluidFM技術(shù)多功能單細(xì)胞顯微操作FluidFM技術(shù)的出現(xiàn)改變了這一現(xiàn)狀,它使用特殊的中空探針能夠輕松地通過負(fù)壓抓取細(xì)胞,取得和AFM近似精度的數(shù)據(jù),無需在探針上進(jìn)行任何修飾,不會改變細(xì)胞表面的任何通路,從而能夠得到接近細(xì)胞原生的數(shù)據(jù)。在實驗結(jié)束后能夠通過正壓快速丟棄用過的細(xì)胞,具備很高的自動化,能夠快速測量細(xì)胞粘附力。使用FluidFM對細(xì)胞操作的基本流程FluidFM在粘附力測量上具備顯著優(yōu)勢。如圖所示,F(xiàn)luidFM能夠通過負(fù)壓將細(xì)胞吸附到原子力探針的末端,通過高精度位移臺的控制將細(xì)胞從基底上分離,并且同時記錄FD曲線。通過FD曲線能夠獲得最 大粘附力Fmax和粘附能量Emax。通過高度自動化的控制系統(tǒng)能夠在短時間內(nèi)測量大量細(xì)胞粘附力,評估細(xì)胞群體分布以及細(xì)胞間差異,并且可有效避免傳統(tǒng)粘附力測量因準(zhǔn)備時間過長而錯過最 佳測量時間導(dǎo)致的細(xì)胞粘附力改變,得到更為精 準(zhǔn)的結(jié)果。
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- 2023-06-09 11:41:52人人都是流式高手:Tumor-infiltrating lymphocytes(TILs) 分選秘籍
- Tumor-infiltrating lymphocytes (TILs) 是指浸潤腫瘤組織的淋巴細(xì)胞。淋巴細(xì)胞是免疫系統(tǒng)中的重要組成部分,負(fù)責(zé)識別和攻擊異常細(xì)胞,包括癌細(xì)胞。流式細(xì)胞術(shù)對TILs的分選提供了一個重要的工具,用于表征、純化和研究浸潤腫瘤的免疫細(xì)胞群。它有助于研究人員了解TILs的組成、功能和潛在的治 療相關(guān)性,推動我們對腫瘤與免疫相互作用的理解。我們使用流式細(xì)胞術(shù)來分選TILs主要應(yīng)用場景如下:01、鑒定和表征:流式細(xì)胞術(shù)允許我們根據(jù)TILs表面標(biāo)記物的特征來鑒定和表征不同的亞群。通過使用針對CD3、CD4、CD8和其他免疫細(xì)胞標(biāo)記物的特異性抗體來標(biāo)記細(xì)胞,我們可以區(qū)分和定量TILs中的各種T細(xì)胞亞群。這有助于我們了解腫瘤微環(huán)境中TILs的組成和多樣性。02、特定TIL亞群的純化:流式細(xì)胞術(shù)分選使我們能夠分離和純化感興趣的特定TIL亞群。通過基于表面標(biāo)記物的表達(dá),對細(xì)胞進(jìn)行分選和篩選,我們可以收集純凈的TIL亞群用于進(jìn)一步的下游應(yīng)用。這使研究人員能夠研究特定的TIL亞群,并研究其功能特性或基因表達(dá)譜。03、功能分析:分選后的TILs可用于功能性分析,以評估其免疫活性和功能。例如,可以測試分選后的TILs的增殖能力、細(xì)胞因子產(chǎn)生、對腫瘤細(xì)胞的細(xì)胞毒性或其他功能性實驗。這些分析提供了有關(guān)TIL亞群功能能力和潛在抗腫瘤免疫反應(yīng)的見解。04、基因組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)分析:流式細(xì)胞術(shù)分選可以獲得純凈的TIL細(xì)胞群,進(jìn)而進(jìn)行基因組學(xué)或蛋白質(zhì)組學(xué)分析。通過分析分選TILs的基因表達(dá)或蛋白質(zhì)譜,研究人員可以更深入地了解與TILs在腫瘤免疫中相關(guān)的分子機(jī)制和信號通路。然而不同于外周血、脾 臟中的淋巴細(xì)胞,TILs的流式檢測存在更多的不確定性,需要有效優(yōu)化包括樣本處理、配色方案、上樣條件以及分析方法等實驗設(shè)計的各個方面,才能實現(xiàn)更為準(zhǔn)確、真實的多色復(fù)雜樣本流式檢測。圖1為外周血來源樣本淋巴細(xì)胞分型的流式檢測數(shù)據(jù),由圖可見,淋巴細(xì)胞群體T、B細(xì)胞分群明顯,T細(xì)胞亞群也可清晰區(qū)分。另外,我們也可以看到,該數(shù)據(jù)以FSC通道設(shè)定閾值,其閾值設(shè)定值較低,導(dǎo)致碎片及噪音信號干擾明顯,不過由于血液樣本碎片較少,與細(xì)胞分群明顯,故而對最 終結(jié)果的影響并不大。圖1 血液樣本淋巴細(xì)胞免疫分型流式數(shù)據(jù)然而,當(dāng)我們使用同樣的模板檢測腫瘤組織樣本時,數(shù)據(jù)就出現(xiàn)了明顯問題。實體瘤組織細(xì)胞構(gòu)成復(fù)雜,并且在將組織樣本制備成單細(xì)胞樣本的過程中會產(chǎn)生大量的細(xì)胞碎片,這些雜質(zhì)細(xì)胞及碎片會對流式檢測造成顯著的干擾。如圖2所示,T細(xì)胞中出現(xiàn)了大量CD19和CD3雙陽性細(xì)胞,不符合已有文獻(xiàn)報道的結(jié)果。這些雙陽性細(xì)胞主要是由于雜質(zhì)細(xì)胞及碎片的非特異干擾導(dǎo)致的。這些干擾對于流式檢測及流式分選的準(zhǔn)確性有很大影響,甚至?xí)?dǎo)致得出錯誤的結(jié)論。圖2 浸潤腫瘤組織的淋巴細(xì)胞免疫分型流式數(shù)據(jù)那么,基于以上數(shù)據(jù),我們應(yīng)該如何優(yōu)化實驗設(shè)計以提高浸潤腫瘤組織的淋巴細(xì)胞分選的準(zhǔn)確性呢?這里給大家以下幾點建議:01、增加Pan-Marker檢測:這里的Pan-Marker是指目標(biāo)細(xì)胞群均表達(dá),但其他細(xì)胞群體及碎片不表達(dá)的表面標(biāo)記。CD45廣泛表達(dá)于免疫系統(tǒng)的各個細(xì)胞亞群上,但在非免疫細(xì)胞上沒有表達(dá)或表達(dá)很低。因此,在檢測淋巴細(xì)胞等免疫細(xì)胞時,可通過檢測CD45是否表達(dá)來區(qū)分免疫細(xì)胞及非免疫細(xì)胞,以達(dá)到排除雜質(zhì)細(xì)胞干擾的目的。02、優(yōu)化樣本制備方案:對復(fù)雜樣本來講,樣本制備方案是否合適決定了流式實驗的成功率??筛鶕?jù)文獻(xiàn)報道并通過預(yù)實驗來選擇最 佳的消化酶配方和消化時間,在確保細(xì)胞得率的同時盡量減少雜質(zhì)干擾并最 大限度的保存細(xì)胞活性及功能。此外,選擇合適的細(xì)胞分離手段進(jìn)行目的細(xì)胞的富集。例如,若針對淋巴細(xì)胞檢測,利用Ficoll或Percoll密度梯度離心法富集單個核細(xì)胞,可有效去除脂肪、碎片及雜質(zhì)細(xì)胞的干擾。03、進(jìn)行Fc封閉:組織浸潤的多種細(xì)胞,特別是單核/巨噬細(xì)胞以及DC細(xì)胞高表達(dá)抗體Fc端的受體。這些細(xì)胞在進(jìn)行流式抗體標(biāo)記時,即使不表達(dá)相關(guān)抗原,也可通過Fc受體非特異性的結(jié)合流式抗體的Fc端,從而導(dǎo)致非特異信號。要解決這一問題,可購買商業(yè)化Fc封閉試劑,在標(biāo)記流式抗體前進(jìn)行Fc封閉即可。04、合理設(shè)定閾值:閾值的設(shè)定與實驗?zāi)康南⑾⑾嚓P(guān)。在流式分析實驗中,應(yīng)當(dāng)設(shè)定閾值去除絕大部分噪音及碎片信號,僅保留少量碎片信號即可。在流式分選實驗中,若分選所得細(xì)胞用于培養(yǎng),同樣應(yīng)當(dāng)設(shè)定閾值去除絕大部分噪音及碎片信號,僅保留少量碎片信號,這樣做可以有效提高分選效率及回收率;但若分選所得細(xì)胞用于qPCR、測序,特別是單細(xì)胞測序等基因組學(xué)應(yīng)用,由于碎片中含有一定量的核酸片段乃至細(xì)胞核碎片,在分選過程中就需要將盡可能多的碎片與目的細(xì)胞區(qū)分,因此應(yīng)當(dāng)設(shè)定較低的閾值以暴露足量的碎片信號讓分選儀器檢測到,進(jìn)而有效確保分選所得目的細(xì)胞不摻雜核酸碎片,以免影響后續(xù)實驗準(zhǔn)確性。05、利用空白熒光通道排除非特異:什么是空白熒光通道呢?舉一個例子,我們設(shè)計一個3色實驗標(biāo)記FITC、PE、PE-Cy7三種染料,沒有標(biāo)記APC,在檢測時APC通道就是空白通道,是不應(yīng)該有陽性信號的。復(fù)雜樣本中的部分雜質(zhì)細(xì)胞有較強(qiáng)的非特異熒光信號,通常這些非特異的熒光信號在所有的流式熒光通道中均可檢測到?;谶@一原理,我們可在上樣時預(yù)留一到兩個空白熒光通道,樣本中的目的細(xì)胞沒有標(biāo)記這些空通道的熒光素,在這些通道里面是陰性的,而雜質(zhì)細(xì)胞的非特異信號在空白通道中通常也是陽性的,我們就可以通過設(shè)門選擇空白通道中的陰性細(xì)胞來達(dá)到去除非特異信號的目的。需要注意的是,利用這一方法時要充分考慮補(bǔ)償?shù)挠绊?,?好選擇與已用通道補(bǔ)償小或無補(bǔ)償?shù)耐ǖ雷鳛榭瞻淄ǖ馈?6、增加細(xì)胞死活染料:死細(xì)胞的非特異性地結(jié)合會增加假陽性。死細(xì)胞會產(chǎn)生自發(fā)熒光干擾特定信號的檢測。在TILs分選中去除死細(xì)胞??梢栽黾訑?shù)據(jù)準(zhǔn)確性:死亡的細(xì)胞可能會釋放細(xì)胞碎片和細(xì)胞內(nèi)成分,這可能會干擾實驗結(jié)果,引入假陽性或假陰性結(jié)果。通過去除死細(xì)胞,可以提高分選結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性。并且為分選后TILs細(xì)胞活力提供保證:分選到活細(xì)胞可以保證后續(xù)實驗的有效性和可靠性。死亡細(xì)胞不具備正常的生物活性和功能,因此分選到活細(xì)胞可以確保后續(xù)實驗?zāi)軌蚍从痴鎸嵉募?xì)胞生物學(xué)狀態(tài)。圖3 無死細(xì)胞排除處理的樣本分析比較圖4 有死細(xì)胞排除處理的樣本分析比較復(fù)蘇后的PBMC在免疫染色之前不添加(圖 3)或者添加ViaKrome 405可固定活性染料(55℃,10分鐘)(圖 4)。然后,使用Perfix-nc細(xì)胞染色試劑盒(型號 B10825)處理細(xì)胞,并用Granzyme B-FITC、CD19-PE、CD14-ECD、CD79a-PC5.5、CD3-PC7 和 CD45- Krome Orange 進(jìn)行染色。 數(shù)據(jù)統(tǒng)計信息顯示:兩個不同條件下,門內(nèi)細(xì)胞在上一門級百分比也不一樣,充分展示了消除死細(xì)胞以后的數(shù)據(jù)效果。
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- 2023-07-03 11:42:58人人都是流式高手:GFP分選,這還有我不會的?
- 很常見的場景如下:細(xì)胞轉(zhuǎn)染后,想用流式檢測表達(dá)GFP細(xì)胞的百分比并且分選,但是不同的設(shè)門方法讓GFP陽性細(xì)胞百分比看起來有差異,究竟下面哪種策略才適合呢?今天我們主要討論一下FSC和SSC上設(shè)門對GFP陽性細(xì)胞百分比的影響。讓我們一個一個設(shè)門,把每種情況具體看一下。保持FITC通道上的門不變,我們來看一下在前向和側(cè)向的散點圖上設(shè)門在不同的位置,代表你選擇了什么類型的細(xì)胞。只有P1賦予了藍(lán)色,其他門的顏色去掉,這樣,我們就可以很方便的看出來細(xì)胞群在不同的圖上所處的位置。第 一種設(shè)門,除了左下角靠近0的碎片不圈,其他基本都圈上,從第二張SSC-A和SSC-H排粘連的散點圖可以看出來有單個細(xì)胞也有粘連細(xì)胞,P2門下 GFP陽性細(xì)胞百分比為61.36%。第二種設(shè)門,只圈最密集的這一群,從第二張SSC-A和SSC-H排粘連的散點圖可以看出來,這部分的細(xì)胞基本都是單個的,P2門下 GFP陽性細(xì)胞百分比為65.39%,較第 一種高。第三種設(shè)門,密集細(xì)胞群左邊的和左下角靠近0的碎片不圈,只圈右邊的這兩群,從第二張SSC-A和SSC-H排粘連的散點圖可以看出來有單個細(xì)胞也有粘連細(xì)胞,P2門下 GFP陽性細(xì)胞百分比為65.70%,較第 一種高,和第二種差不多,但是稍微高一點。這樣分析下來,大家最 大的困惑是這三群細(xì)胞要不要圈,怎么圈才是最 好的?讓我們在第 一張F(tuán)SC和SSC的散點圖上根據(jù)細(xì)胞群設(shè)三個門。三個門分別為P1、P4和P5,顯示了三種不同的細(xì)胞群。P1顯示為單個細(xì)胞,F(xiàn)ITC通道上陽性細(xì)胞比例為65.54%。P4顯示大部分為粘連的細(xì)胞,因此在FITC通道上的陽性細(xì)胞比例為71.43%,較P1細(xì)胞群高,如果分析時加入這群細(xì)胞會增加GFP陽性細(xì)胞百分比。如果在單克隆分選中選擇這群,會導(dǎo)致雖然篩選到陽性細(xì)胞,但是單克隆源性降低。P5顯示為單個細(xì)胞,但是因為FSC較P1小,考慮是細(xì)胞狀態(tài)不好細(xì)胞呈現(xiàn)皺縮導(dǎo)致,所以其在FITC通道上的陽性細(xì)胞比例為20.15%,較P1細(xì)胞群低的多,如果分析時加入這群細(xì)胞則會降低GFP陽性細(xì)胞百分比。如果加入7AAD染料,這群會呈現(xiàn)出陽性,所以在分選中這群細(xì)胞不該圈選,或者在去除死細(xì)胞的門中去除。由此可見,如果只想要分析狀態(tài)好的單個細(xì)胞的GFP陽性百分比,那你可以選擇P1門的設(shè)門方式,當(dāng)然也可以把P1和P4都選上,再用SSC-A和SSC-H去掉粘連細(xì)胞對數(shù)據(jù)的干擾。練習(xí)題如果您在細(xì)胞轉(zhuǎn)染后,流式檢測表達(dá)mCherry細(xì)胞的百分比時發(fā)現(xiàn),mCherry通道細(xì)胞群并沒有呈現(xiàn)明顯分開的兩群(由于細(xì)胞在mCherry通道有較高的自發(fā)熒光),要怎么確定mCherry細(xì)胞百分比并且分選呢?
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- 2023-05-20 12:59:12測定單克隆細(xì)菌群體中單細(xì)胞對抗生素的敏感性
- 鑒于抗菌素耐藥性的出現(xiàn),了解細(xì)胞群體對抗生素反應(yīng)的異質(zhì)性至關(guān)重要。因為藥物可以施加選擇壓力,導(dǎo)致抗性表型的出現(xiàn)。迄今為止,無論是整體方法還是單細(xì)胞方法都無法將單細(xì)胞易感性的異質(zhì)性與人群對抗生素的反應(yīng)聯(lián)系起來。在這里,我們提出了一個平臺,通過使用錨定微流體滴和圖像和數(shù)據(jù)分析管道,測量單個大腸桿菌細(xì)胞在不同環(huán)丙沙星濃度下形成小菌落的能力。微流控結(jié)果與抗生素敏感性的經(jīng)典微生物學(xué)測量結(jié)果進(jìn)行了基準(zhǔn)測試,顯示池微流控芯片與重復(fù)的批量測量結(jié)果之間的一致性。此外,單細(xì)胞形成菌落的實驗可能性用于提供概率抗生素敏感性曲線。除了概率觀點外,微流控格式還可以隨著時間的推移對大量單個細(xì)胞的形態(tài)特征進(jìn)行表征。該管道可用于比較不同菌株對具有不同作用機(jī)制的抗生素的反應(yīng)。
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