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血液直接PCR試劑盒Blood Advanced Direct PCR Kit

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詳細(xì)介紹

        Blood Advanced Direct PCR Kit是一款可直接對(duì)全血樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增而無(wú)需進(jìn)行DNA純化或樣本預(yù)處理的試劑盒,兼容含EDTA、肝素、檸檬酸鹽等常規(guī)抗凝劑的新鮮血液、冷藏(凍)血液及Whatman903®FTA®商用干血漬。試劑盒中含有經(jīng)過(guò)經(jīng)基因工程改造的DNA Polymerase組合,具有保真性高、對(duì)PCR抑制劑耐受性強(qiáng)的特點(diǎn),2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer中添加強(qiáng)力延伸因子、擴(kuò)增增強(qiáng)因子以及優(yōu)化的緩沖體系,能夠在快速延伸條件下高效擴(kuò)增8 kb的基因組片段,對(duì)于2 kb以下的片段,設(shè)置3-5 sec/kb延伸時(shí)間即可完成擴(kuò)增,從而大幅縮短血液樣本的鑒定及檢測(cè)時(shí)間。

       Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix的擴(kuò)增產(chǎn)物的3’端為平末端,適用于一步法快速克隆及TOPO克隆試劑盒(Yeasen CAT# 10907/10908/10909/10910/10911/10912/10922)。
  試劑盒中提供的引物預(yù)混液Positive control primer mix (10 μM each)能夠從哺乳動(dòng)物和大多數(shù)脊椎動(dòng)物的sox21基因上游保守序列中擴(kuò)增出長(zhǎng)度237 bp的片段,可作為陽(yáng)性對(duì)照使用。

 

產(chǎn)品組分

編號(hào)

名稱(chēng)

10188ES20

10188ES50

10188ES60

10188ES76

10188-A

2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer

500 μL

1.25 mL

2.5 mL

12.5 mL

10188-B

Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix

20 μL

50 μL

100 μL

500 μL

10188-C

Positive control primer mix (10 μM each)

100 μL

100 μL

200 μL

500 μL

10188-D

10× DNA loading buffer

1 mL

1 mL

1 mL

1 mL × 5

 

運(yùn)輸與保存方式

干冰運(yùn)輸。-20保存,有效期1年。

 

適用范圍

不同類(lèi)型的全血樣本直接PCR反應(yīng)。

 

注意事項(xiàng)

1. 推薦血液模板使用量為反應(yīng)總體積的10%50 μL反應(yīng)體系中加入5 μL全血作為模板,注意避免吸取血液凝塊。
2. 延伸時(shí)間10 sec/kb可擴(kuò)增8 kb以下大部分目的片段,3-5 sec/kb即可擴(kuò)增大部分2 kb以下片段。若擴(kuò)增效率較低,可適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間至30 sec/kb
3. PCR反應(yīng)結(jié)束后,推薦將反應(yīng)產(chǎn)物于4000 rpm (1000× g) 離心1-3 min以沉淀血細(xì)胞碎片,取上清進(jìn)行下游分析。
4. 本產(chǎn)品不可直接用于醫(yī)療診斷。
5. 為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并佩戴一次性手套操作。

 

PCR反應(yīng)體系a

組分

體積

ddH2O

to 50 μL

2× Hieff® Blood Advanced PCR Buffer

25 μL

Forward Primer (10 μM) b

2 μL

Reverse Primer (10 μM) b

2 μL

Hieff® Advanced High-Fidelity DNA Polymerase Mix

1 μL

血液樣本c

X

a 使用前請(qǐng)充分混勻各組分。

b 推薦每條引物的使用終濃度為0.4 μM,過(guò)高會(huì)導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。

c 最佳全血模板濃度范圍為0.5%-20%,推薦使用量為10%作為初始嘗試條件,即50 μL反應(yīng)體系中加入5 μL全血作為模板,注意避免吸取血液凝塊。對(duì)于貯存在Whatman®濾紙卡上的干血漬,則可取約1 mm2帶血漬的圓紙片,無(wú)需進(jìn)行預(yù)處理,直接放入PCR反應(yīng)液中即可進(jìn)行擴(kuò)增。


PCR反應(yīng)條件

循環(huán)步驟

溫度

時(shí)間

循環(huán)數(shù)

預(yù)變性

95℃

5 min

1

變性

95℃

15 sec

30-35

退火a

60℃

15 sec

延伸b

72℃

3-10 sec/kb

終延伸

72℃

5 min

1

a 退火溫度為通用Tm值或低于引物Tm1-2℃。如果擴(kuò)增產(chǎn)物特異性較差,可以建立退火溫度梯度以尋找最佳退火條件。

b 延伸時(shí)間10 sec/kb可擴(kuò)增8 kb以下大部分目的片段,3-5 sec/kb即可擴(kuò)增大部分2 kb以下片段。若擴(kuò)增效率較低,可適當(dāng)延長(zhǎng)時(shí)間至20-30 sec/kb,不應(yīng)超過(guò)60 sec/kb。


PCR產(chǎn)物分析
PCR反應(yīng)結(jié)束后,推薦將反應(yīng)產(chǎn)物于4000 rpm (1000× g) 離心1-3 min以沉淀血細(xì)胞碎片,取上清進(jìn)行下游分析。該步驟可消除全血中多種殘留成分對(duì)電泳檢測(cè)的干擾,對(duì)使用高濃度血液作為模板的PCR產(chǎn)物尤為必要。通常,5 μL/50 μL (10%)反應(yīng)產(chǎn)物可取30-35 μL上清,3 μL/50 μL (5%)反應(yīng)產(chǎn)物可取40-45 μL上清。若需對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行其它分析,例如酶切等,應(yīng)將產(chǎn)物稀釋2-4倍以降低反應(yīng)中的鹽及其它抑制劑對(duì)反應(yīng)的干擾。


對(duì)照反應(yīng)
試劑盒內(nèi)提供引物預(yù)混液Positive Control Primer Mix (10 μM each) 用于陽(yáng)性對(duì)照反應(yīng)??蓮牟溉閯?dòng)物及其他許多脊椎動(dòng)物的基因組sox 21基因上游序列中擴(kuò)增出237 bp的片段,該擴(kuò)增區(qū)是一段高度保守的非編碼區(qū)。
Primer F: 5'- AGCCCTTGGGGASTTGAATTGCTG -3'   
Primer R: 5'- GCACTCCAGAGGACAGCRGTGTCAATA -3'

 

常見(jiàn)問(wèn)題與解決方案

無(wú)擴(kuò)增產(chǎn)物或產(chǎn)量少

產(chǎn)物呈現(xiàn)高分子量彌散條帶

產(chǎn)物呈現(xiàn)低分子量彌散條帶

檢查引物設(shè)計(jì),確認(rèn)引物濃度和純度

提高退火溫度或設(shè)置退火梯度

電泳前離心取上清

重復(fù)實(shí)驗(yàn),確認(rèn)體系、程序無(wú)誤

延伸時(shí)間不應(yīng)過(guò)長(zhǎng)

提高退火溫度或設(shè)置退火梯度

增加循環(huán)數(shù)

嘗試不同的血液用量

嘗試不同的血液用量

優(yōu)化退火溫度

減少循環(huán)數(shù)

減少循環(huán)數(shù)

嘗試不同的血液用量

降低引物濃度

降低引物濃度

重新設(shè)計(jì)引物

 

重新設(shè)計(jì)引物

HB220617

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